Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRACR2AQ9BSW2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms