Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM175Q9BSA9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms