Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGIP1Q9BQI5 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms