Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms