Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms