Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms