Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2BQ99453 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms