Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms