Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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C2orf48Q96LS8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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C2orf48Q96LS8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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C2orf48Q96LS8 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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C2orf48Q96LS8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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