Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTV1Q96GA3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms