Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RNFT2Q96EX2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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