Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms