Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms