Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms