Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms