Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms