Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms