Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms