Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms