Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms