Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms