Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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