Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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