Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms