Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SPIDRQ14159 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SPIDRQ14159 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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