Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTCH1Q13635 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTCH1Q13635 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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