Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms