Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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