Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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C1orf61Q13536 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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C1orf61Q13536 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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C1orf61Q13536 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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C1orf61Q13536 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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C1orf61Q13536 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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C1orf61Q13536 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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C1orf61Q13536 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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C1orf61Q13536 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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C1orf61Q13536 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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