Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms