Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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