Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms