Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms