Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPAL4Q0D2K0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms