Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PUDPQ08623 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PUDPQ08623 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PUDPQ08623 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PUDPQ08623 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PUDPQ08623 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PUDPQ08623 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PUDPQ08623 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PUDPQ08623 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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