Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms