Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms