Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms