Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms