Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PLOD1Q02809 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms