Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNTN2Q02246 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 395.7 ms