Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK-24P63145 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms