Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms