Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms