Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms