Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms