Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms