Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PTPRMP28827 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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