Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA1P17302 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA1P17302 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms