Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms